- Parentalité stérile et procréation médicalement assistée : le dégel du devenir (avec Claudia Mejia Quijano, première auteure, et Marc Germond), Erès, 2006 ;
- Clinique de la procréation et mystère de l’incarnation : l’ombre du futur (avec Marc Germond, Véronique Mauron, Marie André, Francesca Cascino), PUF, 2007 ;
- A chacun son cerveau, plasticité neuronale et inconscient (avec Pierre Magistretti), Odile Jacob, 2004, réédité en poche, Odile Jacob, 2011 ;
- Neurosciences et psychanalyse : une rencontre autour de la singularité (avec Pierre Magistretti), Odile Jacob, Collège de France, 2010 ;
- Les Énigmes du plaisir (avec Pierre Magistretti ), Odile Jacob, 2010;
- Clinique de l’origine, Editions Cécile Defaut, 2012;
- Autisme: à chacun son génome (avec Ariane Giacobino), Editions Navarin/Champ Freudien, 2012;
- Malaise dans l’institution. Le soignant et son désir, 3ème édition, Anthropos, Paris, 2013;
- Alberini CM, Ansermet F & Magistretti P. Memory reconsolidation, trace reassociation and the Freudian unconscious. In : Alberini CM (Ed.) Memory reconsolidation. Amsterdam : Elsevier/Academic Press, 2013, 293-312;
- A paraître : Les enfants de la science, Editions Odile Jacob, Paris, 2015.